雖然被認為是論文造假者可能遭遇的最嚴厲的懲罰制度，但教育部在7月16日公布的《關于對學位論文作假行為的暫行處理辦法（征求意見稿）》（以下簡稱《辦法》）仍被一些知名打假人士和教育問題觀察者認為存在問題，比如條款太抽象，規定太籠統，一些懲處措施缺乏可操作性等。

　　《辦法》未對抄襲、剽竊的概念作出界定

　　知名學術打假人方舟子告訴中國青年報記者，《辦法》不僅未對抄襲或剽竊的概念作出界定，而且也沒有分清抄襲（或剽竊）的多種不同情況，例如是觀點剽竊、數據抄襲還是文字抄襲，是整體抄襲、大部分抄襲、小部分抄襲還是個別地方抄襲，不同的情節應予不同程度的處理，但這些都沒有具體規定。“這個處理辦法還只是很虛的原則性條條，不具有可操作性。”

　　21世紀教育研究院副院長熊丙奇 (微博)也認為，我們國家沒有學術共同體，評價標準也不一，對抄襲和剽竊的定義各行其是。過去的學術不端或學術腐敗問題難處理，就是因為相關規定原則性過強，可操作性差，即使社會上共同認定的抄襲、剽竊行為，當事人也總會作出“過度引用”等詭辯逃避責任，從而導致對學術失范的“零容忍”變成了“零作為”。“要讓這個《辦法》有可操作性，必須要出臺實施細則，將一些概念作出界定，不能留下太大的自由裁量空間”。

　　復旦大學圖書館館長、教育部社會科學委員會學風建設委員會副主任葛劍雄也認為，這個暫行處理辦法沒有對一些概念比如抄襲、剽竊等作出界定，肯定會在實際案例中引發爭議。“應由主管部門（如教育部學位辦、各省市教委）根據實際情況制定細則。”

　　學生論文有問題該不該問責指導教師

　　《辦法》中的一些具體條款也引發了爭議。如第八條規定，“指導教師未盡到學術道德和學術規范教育、論文指導和審查把關等職責，其負責指導的學生學位論文存在購買、他人代寫或者抄襲、剽竊等作假情形的，學位授予單位視情節輕重，可暫停其招生、取消指導教師資格，并可給予處分直至解除聘任合同等處理”。

　　有聲音認為，學生出的問題不該由教師承擔。

　　方舟子認為，這一條里用了“可”，說得不明確。從理論上說，學生的論文出了問題，指導教師至少負有監督、審查不嚴的責任，對教師給予一定的處罰并非不公。“特別是現在學生當中之所以會出現大面積抄襲的情形，與指導教師不負責任、學校大量擴招有關，如果規定教師也要受處罰，讓教師更負責任，有助于遏制抄襲的泛濫。”

　　葛劍雄也認為，學生論文中出現此類問題，即使教師完全沒有直接責任，至少也說明他不適宜指導學生，所以暫停招生是合適的，并非不公平。

　　重新審查問題論文應限定時間節點

　　《辦法》中第九條規定，“對已經通過答辯的學位論文，發現存在購買、他人代寫或者抄襲、剽竊等作假情形的，該論文評閱人應當重新評閱，學位論文答辯委員會應當重新審查，并分別寫出評閱意見和審查報告，送交學位授予單位的學位評定委員會重新審議”。

　　有聲音認為，重新審查等沒有時間節點的規定，本來該有的調查有可能拖一拖就拖黃了。

　　這種狀況確曾出現過。比如，中國青年報曾揭露廣州體育學院原院長許永剛博士論文存在嚴重抄襲問題，當事人許永剛已于2011年3月受到撤銷黨內職務、行政撤職處分，調離廣州體育學院。

　　然而，今年4月，記者向許永剛的博士學位授予單位蘇州大學求證后發現，許永剛的博士學位仍未被撤銷，有關負責人的答復是“此事正在按有關規定處理”。

　　記者發現，蘇州大學2009年公布的《蘇州大學碩士、博士學位授予工作細則》雖規定：“對于已經授予的學位，如確認學位錯授或發現有舞弊作偽等違反學位規定者，院(部、所、中心、室)學位評定分委員會和校學位評定委員會應予復議，經半數以上成員通過，校學位評定委員會可作出撤銷已授學位等有關決議。”但該細則也沒有作出時限上的規定。